Ulosteen pH on normaalisti neutraali tai lievästi emäksinen (6,8 - 7,5). Happammat ulosteet, jotka ovat fysiologisia vain vastasyntyneelle, voivat viitata suolistotulehduksiin (Escherichia coli, rotavirus) tai ruoansulatuskanavan häiriöihin, kuten laktoosi- tai rasva -intoleranssiin (haiman vajaatoiminnasta tai sappitapauksesta johtuva steatorrea).
Ulosteen pH -arvoon vaikuttavat kohteen ruokailutottumukset; esimerkiksi lihan ja maitotuotteiden runsas ruokavalio tekee ulosteesta emäksisemmän. Mädäntyvä suolistobakteerifloora itse asiassa tuhoaa imeytymiseltä vältytyt aminohapot ja muodostaa myrkyllisiä ja haisevia amiineja; näin ollen ulosteiden pH: lla on taipumus nousta ammoniakin lisääntyneen tuotannon seurauksena. Siksi ei ole sattumaa, että ulosteen pH, joka on liian emäksinen ja johon liittyy lyhytketjuisten rasvahappojen väheneminen (ks. Butyraatti), on yhdistetty kolorektaalisyövän riskiin.
Jos ulosteiden pH: lla on taipumus nousta mätänevän dysbioosin esiintyessä, se pyrkii pienenemään fermentoivan dysbioosin esiintyessä, jonka syyt löytyvät hiilihydraattien liiallisesta nauttimisesta tai huonosta imeytymisestä ( keliakia). Jopa "runsaan lipidien saannin läsnä ollessa, kasvisruokavaliossa ja pitkäaikaisessa paastossa ulosteen pH muuttuu happamaksi.
Testitulosten vääristymisen välttämiseksi uloste ei saa olla virtsan saastuttama, ja se on jäähdytettävä nopeasti, jotta virtsan ammoniakki ja mätänevät bakteerit eivät tee emäksistä pH -arvoa emäksiseksi.